每當談論起果蔬農殘問題，人們習慣性地認爲日本、歐洲等國家做得很好，但事實卻是，日本是世界上農藥使用量最高的國家，用他們的話說就是“沒有農藥就沒有農業”。即使沒有2011年東日本大地震引發的核電站泄漏事故，日本的農產品一樣無法出口到歐美，因爲日本農產品農藥殘留量是美國的5倍，遠高於歐洲和美國規定的安全用量。農藥殘留量這麼高，和日本農戶種植過程中大量使用農藥有關，由此引起的環境問題也日益嚴重。
化學農藥用量超高日本的氣候高溫潮溼，田間容易生長雜草、繁殖害蟲。在種植作物之前，日本農戶會反覆噴灑好幾遍“土壤消毒劑”。農作物生長期間，還要不停噴灑除草劑、殺蟲劑和殺菌劑。噴灑農藥是日本農戶種植成本中最高的一項，以前他們會租賃小型飛機噴灑農藥，現在越來越多農戶購買中國大疆無人機來噴灑。日本超市或者果蔬店的水果一般不按照斤賣，而是按照個賣。這些水果大小几乎一致，漂亮、整齊，同一種水果之間重量相差不超過5克。也是因爲日本人在種植過程中進行了大量人工干預，除了噴灑殺蟲劑外，還使用化學藥品控制果子發育程度，所以果實幾乎一樣大、一樣紅、一樣重。土地變“毒土壤”，農產品靠進口大量使用農作物化學制劑的後果便是，日本的環境和民衆健康都受到了一定傷害。首先是日本農田土壤因常年噴灑農藥，變成了“毒土壤”，現在日本農業研究的一大課題就是如何給毒土壤清毒。
其次，農藥噴灑時會讓大氣中充滿農藥顆粒，在氣流作用下會轉移到很遠的地方，或者懸浮在空中久久不能散去。加之日本高溫潮溼的氣候，導致農藥容易揮發但不易散去，對大氣造成的污染十分嚴重。再次，日本四面環海、內河多，且雨量充沛，大量的雨水沖刷農田後，土壤中的農藥會隨之流入內河和大海，污染水源。1996年，日本東北部山村就曾發生過農殘污染飲用水導致的集體中毒事件。當地5個村莊居民因飲用有農藥殘留的山林水源，導致100多人死亡，多名孕婦流產或產下畸形兒童，教訓非常慘痛。
日本人也不放心吃本國的自產蔬果，於是他們研發出五花八門的清洗蔬菜水果農藥殘留的專用洗滌劑，甚至細化到一種水果配一種洗滌劑的地步，這也因此成爲日本的一大特色。
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