打點滴病毒唑的副作用比較大，不僅會引起身體的各種不適，比如噁心、嘔吐、頭疼、疲勞等，還會引起溶血性貧血等。
常見的副作用有疲倦，頭痛，失眠，食慾減退，輕度腹瀉等，停藥後症狀會逐漸消失。溶血性貧血，服用後1-2周後會有血紅蛋白降低，10%左右會有心肺副作用。在治療前和治療期間要經常監測血紅蛋白，地中海貧血和鐮刀細胞貧血的病人不宜使用，如果是胰腺炎症或者是有胰腺炎的病人就不要服用。長時間服用該藥物會導致白細胞減少、貧血、血清轉氨酶、膽紅素增高。兒童肌肉或靜脈內注射此藥後會有過敏反應，主要有紅色丘疹、蕁麻疹、支氣管哮喘、輸液樣反應等。
因此該藥物需要在醫生指導下謹慎使用。
